Bersama para santrinya, ia aktif dalam gerakan antipemurtadan yang merambah kalangan bangsawan keraton. Ia juga bercita-cita mendirikan pemerintahan Islam di Jawa.
Keterlibatan dalam Perang Jawa
Ketika konflik antara Pangeran Diponegoro dan pemerintah kolonial Belanda meletus pada 1825, Kyai Modjo langsung bergabung.
Sejak hari pertama pasukan Pangeran Diponegoro berkumpul di Gua Selarong, ia ikut menyusun strategi perang gerilya. Selain itu, ia menjadi perwakilan dalam negosiasi penting dengan Belanda pada 29 Agustus 1827 di Klaten.
Sebagai pemimpin spiritual, Kyai Modjo berhasil merekrut banyak ulama dan pemuka agama, termasuk 88 kiai desa, 11 syekh, 18 pejabat agama, serta puluhan guru mengaji dari berbagai daerah seperti Bagelen, Kedu, Mataram, Pajang, Madiun, dan Ponorogo.
Ia juga mengubah stigma perjuangan Diponegoro dari pemberontakan menjadi perang suci melawan penjajahan.
Namun, Kyai Modjo mulai meragukan pendekatan Pangeran Diponegoro yang menggunakan konsep Ratu Adil dan mengaku menerima wahyu dalam semedi.
Ia menilai bahwa janji membentuk pemerintahan Islam di Pulau Jawa tidak ditepati. Hal ini memuncak pada 25 Oktober 1828, ketika Kyai Modjo mengadakan perundingan dengan Belanda terkait pemberian wilayah kekuasaan kepada Pangeran Diponegoro.
Penangkapan dan Pengasingan
Baca Juga:Dulu Nyaris Roboh, Kini Ndalem Sasana Mulyo Keraton Solo Bak 'Lahir Kembali' dan Berdiri Tegak
Pada 12 November 1828, Kyai Modjo ditangkap Belanda di Mlangi, Sleman. Ia meminta agar para pengikutnya dibebaskan, dan permintaan itu dikabulkan.